Une petite centrale hydraulique doit - comme toute autre centrale hydraulique - respecter intégralement toutes les lois environnementales. Pour les nouveaux projets, le canton examine si la production d'électricité est en bon rapport avec les éventuelles atteintes à la nature et au paysage. Les projets ayant un impact négatif sur l'écologie des cours d'eau doivent l'atténuer autant que possible ou le compenser par des mesures de compensation. Dans le cas contraire, ils ne sont pas autorisés.
Les besoins écologiques sont soigneusement pris en compte : La montée et la descente des poissons permettent une libre migration des poissons. Des grilles fines ou horizontales et des dispositifs de guidage des poissons permettent d'éviter que les poissons ne nagent en direction des turbines. La quantité d'eau résiduelle est même souvent plus généreuse que dans les grandes centrales. De grands clapets de barrage assurent le transport des sédiments vers l'aval, au fond du cours d'eau.